以下是生化危机（Resident Evil）1、2、3三款游戏的主要剧情介绍：
生化危机 (Resident Evil / Biohazard) 1 (1996)
- 背景: 1996年，美国浣熊市（Raccoon City）。
- 开端: S.T.A.R.S.（特别行动与救援部队）的阿尔法小队前往浣熊市郊外的一处废弃设施——蜂巢实验室（Umbrella Corporation's Spencer Mansion）调查一起连环杀人案。队员里昂·斯科特·肯尼迪（Leon S. Kennedy）的任务是保护当地的政府官员吉尔·瓦伦丁（Jill Valentine）。
- 事件: 队员们进入实验室后，发现实验中用于制造T病毒（T-Virus）的伞公司员工已经发生变异，变成了没有理智的僵尸（Zombie）。病毒开始泄漏，整个实验室陷入混乱。队员们在调查过程中逐渐揭开伞公司进行非法病毒实验、试图制造生化武器的真相。
- 高潮: 里昂和吉尔与变异体、包括强大的Boss——暴君（Mr. X / Nemesis）展开激烈战斗。他们最终破坏了实验室的核心，阻止了更大规模的病毒泄漏，但也付出了惨重代价（如克里斯·雷德菲尔德 Chris Redfield 队友牺牲）。
- 结局: 里昂成功救出吉尔，两人乘坐直升机逃离即将爆炸的蜂巢实验室。浣熊市随后被联邦政府封锁并摧毁。里昂和吉尔意识到，伞公司只是冰山一角，更大的威胁还在后面。
生化危机2 (Resident Evil 2 / Biohazard 2) (1998)
- 背景: 1998年，浣熊市毁灭后的几年。里昂·斯科特·肯尼迪在浣熊市事件后加入了浣熊市警察局。
- 开端: 里昂接到任务，前往浣熊市郊外的新建城市——里昂维尔（Raccoon City Rebuilt / Raccoon City Remade），调查一起新的僵尸事件。他在前往警局的路上就遭遇了袭击。
- 故事线A (里昂路线): 里昂在警局与老相识的吉尔重逢。两人联手调查事件源头——位于城市地下的旧政府研究设施（ Police Department B.O.W. Testbed）。他们发现城市供水系统被感染，市民在饮用水源后也会变成僵尸。里昂在深入调查的过程中，不仅要对抗不断涌出的僵尸和变异体，还要面对神秘的恐怖分子“保护伞”（Umbrella's offshoot, the G-Virus cult），并最终与实验改造人杰森·沃伦（Jason Voorhees）战斗。里昂最终阻止了水源污染，但吉尔为了掩护他撤退而被捕。
- 故事线B (克莱尔路线): 克莱尔·雷德菲尔德（Claire Redfield）为了寻找失踪的哥哥克里斯·雷德菲尔德而来到了里昂维尔。她同样在调查僵尸事件，并发现了与伞公司有关联。克莱尔追踪线索，前往旧政府研究设施，途中遇到了里昂（两人最初互相敌视）。克莱尔在设施内解开了谜题，获得了前往浣熊市地下的权限，以寻找哥哥的下落。她最终到达了蜂巢实验室的核心区域。
- 结局: 两个故事线最终汇合。里昂和克莱尔在蜂巢实验室深处汇合，与伞公司的科学家和最终Boss——贝克特（Albert Wesker）展开决战。贝克特试图启动包含G病毒和T病毒的最终兵器“红女巫”（Tyrant Red）。里昂和克莱尔联手击败了贝克特，阻止了“红女巫”的启动。里昂和克莱尔成功逃离了正在崩溃的蜂巢实验室。贝克特则乘坐运输火箭逃离。
生化危机3: 诅咒 (Resident Evil 3: Nemesis / Biohazard 3: Code Veronica) (1999)
- 背景: 事件发生在大约一年后，浣熊市已被更名并重建为“瑞克市”（Raccoon City Rebuilt / Raccoon City Remade）。里昂和克莱尔事件后，伞公司全球总部在澳大利亚的沃里克岛（Wesker Island）的实验室也发生了病毒泄漏。
- 开端: 里昂和克莱尔被派往沃里克岛调查。两人被迫分开行动。里昂在岛上遭遇了以追杀S.T.A.R.S.队员为乐的生化恐怖分子头目——杰森·沃伦。克莱尔则负责在岛上的实验室内寻找哥哥克里斯。
- 里昂路线: 里昂在岛上与杰森展开连番激战。他不仅要对抗杰森，还要面对其他变异体和伞公司的防御部队。他最终在实验室找到了关于伞公司创始人——詹姆斯·斯宾塞（James Marcus）的线索，并再次与杰森决战。里昂击败了杰森，但杰森并未死亡。
- 克莱尔路线: 克莱尔在实验室内解谜，寻找哥哥。她遭遇了杰森的袭击，并在逃亡过程中意外卷入了病毒泄漏的中心。她最终在海上漂流，被一艘货轮救起。
- 结局: 里昂在撤离过程中再次遭遇杰森，两人最终决战于撤离码头的停尸间。里昂利用杰森的弱点（对火焰的恐惧和依赖）将其彻底击败，使其陷入沉睡。里昂和克莱尔乘坐直升机逃离了爆发大规模感染的沃里克岛。杰森的命运则成为了一个悬而未决的谜团。伞公司作为幕后黑手的形象进一步确立，而贝克特和杰森则成为了后续作品中的重要角色。
总结来说，前三代故事主要围绕伞公司进行的非法病毒实验及其造成的灾难性后果展开，塑造了里昂、吉尔、克莱尔、克里斯等核心角色，并引入了杰森、贝克特等经典的生化恐怖符号，奠定了整个生化危机系列“病毒泄漏、城市沦陷、人类与变异体对抗”的核心模式。
